Так ведь Сергей Чикуёнок про это писал давно (http://chikuyonok.ru/2009/02/png/). Вот именно про эту программу писал. Я давно пользуюсь.

А толку от этого? Если нужный цвет известен заранее, так можно вообще прозрачность убрать.